Kota Yogyakarta terletak antara 110°24'19"-110°28'53" Bujur Timur dan antara 07°15'24"-07°49'26" Lintang Selatan, dengan luas sekitar 32,5 Km2 atau 1,02% dari luas wilayah Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta. Jarak terjauh dari Utara ke Selatan kurang lebih 7,5 Km dan dari Barat ke Timur kurang lebih 5,6 Km. 

      Kota Yogyakarta memiliki luas sekitar 32,5 Km2 atau 1,02% dari luas wilayah Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta. Jarak terjauh dari Utara ke Selatan kurang lebih 7,5 Km dan dari Barat ke Timur kurang lebih 5,6 Km. Kota Yogyakarta yang terletak di daerah dataran lereng aliran Gunung Merapi memiliki kemiringan lahan yang relatif datar antara 0 - 2% dan berada pada ketinggian rata-rata 114 meter dari permukaan air laut (dpa). Sebagian wilayah dengan luas 1.657 hektar terletak pada ketinggian kurang dari 100 meter dan sisanya pada ketinggian antara 100–199 meter dpa.  Sebagian besar jenis tanahnya adalah regosol.

    Terdapat tiga sungai yang mengalir dari arah Utara ke Selatan yaitu: Sungai Gajahwong yang mengalir di bagian timur kota, Sungai Codedi Bagian tengah dan Sungai Winongo di bagian barat kota.

      Secara administratif Kota Yogyakarta terdiri dari 14 kecamatan dan 45 kelurahan dengan batas wilayah sebagai berikut:

Sebelah Utara     :  Kabupaten Sleman

Sebelah Timur    :  Kabupaten Bantul  dan Sleman

Sebelah Selatan :  Kabupaten Bantul

Sebelah Barat     :  Kabupaten Bantul

 

Kecamatan	Luas (km2)	Presentase
Mantrijeron	2.61	8.03
Keraton	1.40	4.31
Mergangsan	2.31	7.11
Umbulharjo	8.12	24.98
Kotagede	3.07	9.45
Gondokusumo	3.99	12.28
Danurejan	1.10	3.38
Pakualaman	0.63	1.94
Gondomanan	1.12	3.45
Ngampilan	0.82	2.52
Wirobrajan	1.7	5.42
Gedongtengen	0.96	2.95
Jetis	1.70	5.23
Tegalrejo	2.91	8.95
Jumlah	32.50	100.00

Kecamatan	Tinggi Wilayah (mdpl)	Jarak ke Ibukota (km)
Mantrijeron	113.00	5.50
Keraton	114.00	4.50
Mergangsan	119.30	2.00
Umbulharjo	126.00	0.80
Kotagede	110.00	1.50
Gondokusumo	152.00	3.00
Danurejan	159.00	2.60
Pakualaman	157.00	1.00
Gondomanan	96.00	3.00
Ngampilan	125.00	5.00
Wirobrajan	128.00	5.00
Gedongtengen	156.90	5.00
Jetis	114.00	4.00
Tegalrejo	128.90	6.00

      Secara umum, jumlah curah hujan tertinggi selama 2019 terjadi pada bulan Maret, yaitu 648,40 mm³ dan terendah terjadi pada bulan Juni yaitu sebanyak 1,00 mm³ . Rata-rata hhari hujan per bulan adalah 9,25 hh/rd. Kelembamam udara rata-rata cukup tinggi yaitu berada pada kisaran 77 - 88 persen, dimana yang terendah terjadi pada bulan September yaitu sebesar 77 persen. Kelembamam udara tinggi terjadi pada bulan maret, dan Januari mencapai 88 persen.